主讲人：王福旭 哈工大计算学部博士研究生
时间：2021年03月01日 20:00~21:00
地点：科创大厦J2018
研究方向：深度学习、靶点识别与发现
内容简介：
本报告的研究目的是通过预训练方法对蛋白质序列进行分词，对蛋白质进行主题抽取，从而将蛋白质进行表征，解决大量测序蛋白无法表征的问题。随后通过蛋白质特征对MHC I 类分子与多肽的结合进行预测，以解决目前的 HLA 抗原表位预测算法特异性较低的问题。
本报告有如下内容：
(1)基于 motif 先验知识，通过对蛋白质语料库进行预训练，能够进一步理解蛋白质的特性。
(2)通过上述蛋白质表征，有助于对蛋白质的进行主题抽取。
(3)基于transformer预测 MHC I 类分子与多肽结合 ，有效识别新抗原（neoantigen）。
(4)在以上基础对 MHC I 类分子与多肽结合的预测。
